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科研服務(wù)

核酸提取基因克隆載體構(gòu)建 Real Time PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)菌種鑒定

菌種鑒定需提取基因組DNA，利用PCR擴(kuò)增特定rDNA片段，在GeneBank上進(jìn)行序列比對(duì)，一般序列相似度在97%以上就可以認(rèn)為是同種菌。箭速基因擁有微生物菌種分類鑒定的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室，配有PCR儀、高速冷凍離心機(jī)、電泳儀、HPLC、凝膠成像系統(tǒng)、紫外控溫分析系統(tǒng)等先進(jìn)儀器設(shè)備，采用序列分析法，方便、快捷地完成各種細(xì)菌的分子生物學(xué)鑒定幫助您獲得真實(shí)、可信的結(jié)果。

樣本類型

1.樣品形式要求：帶有單一菌種的單菌落培養(yǎng)平板或斜面（比例占試管1/2以上，但不要超過(guò)3/4）、無(wú)明顯降解的基因組DNA（濃度不低于10 ng/μl，總體積至少大于20μl）。

2.對(duì)于細(xì)胞壁較厚的革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌，常規(guī)方法難以破壞細(xì)胞壁，建議您提供基因組DNA(用乙醇沉淀法去除PCR抑制物)。

3.厭氧菌、放線菌等特別菌株請(qǐng)?jiān)诜?wù)開(kāi)展前與技術(shù)支持進(jìn)行溝通。

4.為保證實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行，建議樣本低溫運(yùn)輸。

一、細(xì)菌菌種鑒定

細(xì)菌的rRNA有5S、16S和23S三種。其中16S rRNA分子量約1500bp,所代表的細(xì)菌信息量適中，適合進(jìn)行分類研究。

服務(wù)內(nèi)容

1、細(xì)菌16S rDNA部分序列解析

擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA的全長(zhǎng)序列，只使用Seq forward進(jìn)行一個(gè)測(cè)序反應(yīng)(有效序列500～600 bp)，即可得到含有部分種屬特異性的16S信息，是一種較為經(jīng)濟(jì)便捷的鑒定方法。

2、細(xì)菌16S rDNA全序列解析

擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA的全長(zhǎng)序列，長(zhǎng)度約1400 bp～1500 bp，進(jìn)行三個(gè)測(cè)序反應(yīng)，測(cè)得全長(zhǎng)序列，即較為全面的種屬特異性信息。

價(jià)格及周期

交付內(nèi)容

1、PDF版實(shí)驗(yàn)報(bào)告

2、測(cè)序彩色波形圖

3、序列堿基圖

4、NCBI比對(duì)結(jié)果

二、真菌26S rDNA D1/D2區(qū)序列解析

真菌基因組中編碼核糖體RNA的基因有四種：26S rDNA、5S rDNA、18S rDNA和5.8S rDNA.真菌大亞基上的26S rDNA 可分為D1、D2…D12等多個(gè)區(qū)域，其中D1/D2區(qū)域序列長(zhǎng)度適中,適合于真菌鑒定。

服務(wù)內(nèi)容

1、真菌26S rDNA D1/D2區(qū)序列解析。

擴(kuò)增真菌26S rDNA D1/D2區(qū)片段，長(zhǎng)度約500～600 bp，只需進(jìn)行一個(gè)測(cè)序反應(yīng)，即可得到26S rDNA D1/D2區(qū)序列信息。該方法特別適合酵母菌的鑒定。

2、真菌ITS全列序列解析。

PCR擴(kuò)增真菌ITS區(qū)片段，長(zhǎng)度約300～1,000 bp，依據(jù)PCR擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度，進(jìn)行一個(gè)至兩個(gè)測(cè)序反應(yīng)，即可得到ITS區(qū)全序列信息。對(duì)于一些真菌，26S rDNA D1/D2區(qū)或ITS區(qū)結(jié)構(gòu)復(fù)雜，進(jìn)行一個(gè)方向的測(cè)序可能不能得到全序列，這時(shí)需同時(shí)進(jìn)行反方向的序列測(cè)定。

價(jià)格及周期